V roku 1997 riaditeľka školy Marta  Gabužďová odchádza do dôchodku  a na jej miesto prichádza  z Bardejova  RNDr. Michal Smoliga .

Od roku 1998 škola má dvoch zástupcov. Pre  ročníky 1.-4. do 30.júna 1998 je zástupcom Mgr.Tomáš  Demjanovič a od 1.júla na  jeho miesto prichádza Mgr. Anna Balážová.

Zástupkyňou pre ročníky 5.-9.od 1.2. 1998  do roku 2002 je RNDr. Marta Artimová. Koniec 20. storočia a začiatok  tretieho tisícročia  je poznamenaný  zmenami v celej spoločnosti a tieto priniesli obrovské zmeny  aj  na všetkých stupňoch  škôl  po stránke materiálnej  a obsahovej .

V roku 2000  na  miesto riaditeľa  školy  bol Okresným úradom  Odborom školstva v Bardejove dosadený PhDr.Vladimír Čorňák a po ňom  po výberovom konkurznom konaní preberá funkciu riaditeľa v roku 2002 Mgr. Igor Drotár.